MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 4970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004605	AAG	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004605	AT	3	6	39	44	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004605	TA	3	6	152	157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004605	GGA	2	6	219	224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004605	AG	3	6	227	232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004605	CAAG	2	8	441	448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004605	CAA	2	6	677	682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_004605	AG	3	6	693	698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004605	CAT	2	6	813	818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_004605	ATC	2	6	820	825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004605	ATC	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004605	ATC	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004605	A	7	7	955	961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004605	TAA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004605	AAT	2	6	1035	1040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004605	A	6	6	1059	1064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004605	T	6	6	1070	1075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004605	TTTA	2	8	1077	1084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004605	TTC	2	6	1102	1107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004605	TGAT	2	8	3160	3167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004605	GAT	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004605	TGA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004605	CATT	2	8	3317	3324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_004605	T	8	8	3363	3370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004605	TTC	2	6	3399	3404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004605	GAA	2	6	5717	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004605	TGAA	2	8	5760	5767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004605	A	7	7	5802	5808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004605	TGA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004605	GT	3	6	6005	6010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004605	GGA	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004605	TC	3	6	6224	6229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004605	GCTG	2	8	6260	6267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_004605	CAT	2	6	6288	6293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004605	TGTT	2	8	6318	6325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004605	TGCT	2	8	6361	6368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_004605	AT	3	6	6407	6412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004605	ATT	3	9	8400	8408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004605	GCG	2	6	10696	10701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004605	TCC	2	6	10711	10716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_004605	AG	3	6	10788	10793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004605	GTT	2	6	11531	11536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004605	A	6	6	11539	11544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004605	T	6	6	11563	11568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004605	TAC	2	6	12679	12684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_004605	AAC	2	6	12713	12718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004605	AG	3	6	12728	12733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004605	TTA	2	6	16541	16546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004605	TGC	2	6	19748	19753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004605	CAT	2	6	19782	19787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_004605	TCTA	2	8	20446	20453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004605	CTA	2	6	20466	20471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_004605	ATC	2	6	20472	20477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_004605	A	7	7	20483	20489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004605	AGA	2	6	20501	20506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004605	GGC	2	6	21070	21075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004605	AT	3	6	22887	22892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004605	TATT	2	8	22896	22903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004605	TAG	2	6	22931	22936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004605	GA	3	6	22937	22942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004605	GAAT	2	8	24270	24277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004605	TGT	2	6	24355	24360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004605	GTT	2	6	24383	24388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004605	GCA	2	6	24399	24404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004605	CT	3	6	24442	24447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_004605	TTG	2	6	25161	25166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004605	TAAG	2	8	25330	25337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004605	TGAA	2	8	25584	25591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004605	GGA	2	6	25617	25622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004605	AAT	2	6	25633	25638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004605	TAAAAA	2	12	26912	26923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004605	T	7	7	26948	26954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004605	TA	4	8	29067	29074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004605	AGAA	2	8	29099	29106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004605	CA	3	6	29123	29128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004605	T	6	6	29193	29198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004605	AAC	2	6	29219	29224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_004605	ATTAAA	2	12	29324	29335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004605	TC	3	6	29421	29426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_004605	A	6	6	29459	29464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004605	AAAGCC	2	12	30739	30750	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_004605	T	6	6	30768	30773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004605	CAG	3	9	30856	30864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_004605	TTC	2	6	31746	31751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004605	T	6	6	32847	32852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004605	A	6	6	32959	32964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004605	A	6	6	33344	33349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004605	GAA	2	6	33383	33388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004605	TCAC	2	8	33404	33411	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_004605	ATG	2	6	33417	33422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004605	TTG	2	6	33428	33433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004605	TGA	2	6	33838	33843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004605	T	6	6	33899	33904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004605	GTC	2	6	33905	33910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004605	TAAT	2	8	33918	33925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004605	CTTT	2	8	34920	34927	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_004605	TGTT	2	8	36158	36165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004605	GT	3	6	36175	36180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004605	TGA	2	6	36217	36222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004605	TTA	2	6	36225	36230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004605	T	6	6	36285	36290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004605	TCA	2	6	36499	36504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_004605	CTC	2	6	36518	36523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_004605	TTG	2	6	36528	36533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004605	GAT	2	6	36611	36616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004605	TAA	2	6	36646	36651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004605	GTT	2	6	36715	36720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004605	GTT	2	6	36839	36844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004605	CGG	2	6	40359	40364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004605	TAA	2	6	40412	40417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004605	ATG	3	9	40473	40481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004605	ACA	2	6	40517	40522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_004605	CGG	2	6	42290	42295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_004605	AAC	2	6	42346	42351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_004605	CAG	2	6	42355	42360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_004605	CTTGT	2	10	42399	42408	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_004605	GA	3	6	42446	42451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004605	CGC	2	6	42520	42525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_004605	TGT	2	6	42635	42640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004605	T	6	6	42675	42680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004605	GTGA	2	8	42681	42688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004605	GTGA	2	8	42724	42731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004605	GA	4	8	42730	42737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004605	TTAC	2	8	43826	43833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_004605	A	6	6	43844	43849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004605	CATG	2	8	43882	43889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004605	A	6	6	43890	43895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004605	CTT	2	6	43951	43956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_004605	ATA	2	6	44004	44009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004605	A	6	6	44045	44050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004605	ATG	2	6	45656	45661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004605	A	6	6	45675	45680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004605	TAGCTT	2	12	45715	45726	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_004605	TC	4	8	48313	48320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_004605	GCT	2	6	48354	48359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_004605	GAT	2	6	48374	48379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004605	AG	3	6	48421	48426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004605	T	8	8	48427	48434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004605	A	8	8	48439	48446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004605	GA	3	6	48470	48475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004605	TAAA	2	8	48479	48486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004605	AAT	2	6	48525	48530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004605	AATTA	2	10	48549	48558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004605	TGGT	2	8	48575	48582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004605	CGA	2	6	48590	48595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_004605	TTA	2	6	48613	48618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004605	A	6	6	48668	48673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004605	T	6	6	49199	49204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004605	TGG	2	6	49209	49214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_004605	T	6	6	49833	49838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_004605	GTT	2	6	102294	102299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_004605	ATA	2	6	102365	102370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_004605	GTT	2	6	103539	103544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_004605	TGT	2	6	104102	104107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_004605	T	6	6	106641	106646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_004605	AAC	2	6	136133	136138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_004605	TAC	2	6	136165	136170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_004605	AGT	2	6	136295	136300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_004605	GA	3	6	136801	136806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
432	NC_004605	TTA	2	6	136928	136933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_004605	CGG	2	6	137054	137059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_004605	ATG	2	6	137130	137135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_004605	TAC	2	6	137228	137233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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438	NC_004605	ACC	2	6	137325	137330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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442	NC_004605	GGT	2	6	137548	137553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_004605	CGG	2	6	137635	137640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_004605	TCA	2	6	137663	137668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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448	NC_004605	GT	3	6	137996	138001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
449	NC_004605	ACA	2	6	138057	138062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_004605	AAC	2	6	138292	138297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_004605	GTCG	2	8	138509	138516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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461	NC_004605	A	6	6	138867	138872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_004605	CTA	2	6	139341	139346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_004605	TCC	2	6	139347	139352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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466	NC_004605	T	6	6	140486	140491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_004605	CAT	2	6	140526	140531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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469	NC_004605	CTT	2	6	141883	141888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_004605	T	6	6	142052	142057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_004605	TA	3	6	143055	143060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_004605	AAT	2	6	145410	145415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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